Traitement à haut débit pour l’extraction et la normalisation d’ADN à partir de cartes FTA sur la plateforme KINGFISHER PRESTO couplée à l’automate de pipetage HAMILTON

  • Par la rédaction du site PJGN
  • Publié le 22 novembre 2022, mis à jour le 22 novembre 2022
Mots clefs 

Analyses Génétiques - Optimisation de méthode - Extraction d'ADN

 

Résumé

Notre laboratoire d’analyses génétiques, au sein de l’IRCGN est une chaine analytique haut-débit avec un contrat capacitaire de 135000 échantillons par an. A l’heure actuelle, ces échantillons sont analysés avec un taux d’utilisation des automates est de 85%.

Dans la quête de perfectionnement de ce processus, l’optimisation de la partie extraction est un levier d’amélioration. L’automate d’extraction PRESTO est couplé à l’automate de pipetage HAMILTON permettant un travail en parallèle. Cette méthode d’extraction a été évaluée suivant plusieurs critères.

Après avoir comparés la méthode d’extraction actuelle avec plus de 1200 échantillons représentatifs du panel de profils génétiques analysés, les résultats permettent de démontrer que l’automate d’extraction PRESTO apporte la possibilité de :

  • Fluidifier le flux analytique
  • Diminuer le temps du protocole d’extraction et analyser 3 listes de travail au lieu de 2 dans un même temps. Avec cette méthode, le taux d’utilisation des automates est de 58%.
  • Diminuer la quantité de tampon d’extraction afin de réaliser une économie importante.
  • Améliorer la qualité de l’extraction.

2022

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