Mise en place d'un contrôle interne de process pour sécuriser les analyses ADN à haut débit dans le cadre du développement du kit Investigator 24 Plex QS
- Par la rédaction du site PJGN
- Publié le 22 novembre 2022, mis à jour le 22 novembre 2022
Mots Clefs
Analyses ADN - Suivi - Contrôle de process
Résumé
Le Service Central d'Analyses Génétiques de la Gendarmerie-Traces centralise et réalise l'analyse de prélèvements traces sur supports standardisés dans le but d'alimenter le Fichier national Automatisé des Empreintes Génétiques. Il dispose à cet effet de deux chaînes d'analyse semi-automatisées lui permettant d'analyser annuellement plus de 60 000 prélèvements.
Bien qu’ayant fait l’objet de validations poussées en vue de s’assurer de la fiabilité des protocoles et de la qualité des résultats obtenus, des anomalies de pipetage, ponctuelles et aléatoires, peuvent survenir durant le processus de traitement des plaques. Ces anomalies peuvent être à l’origine de résultats faussement négatifs, s’apparentant à une absence d’ADN sur le prélèvement d’origine.
Le choix de l’utilisation du kit Investigatrice 24 Plex QS a permis de sécuriser une partie du process à l’aide des quality sensors ajoutant un double contrôle : d’inhibition à la réaction de PCR et de transfert lors de la préparation des plaques pour le séquençage. Toutefois, l’ensemble des opérations de pipetage avant la PCR, depuis la lyse jusqu’à la préparation des plaques de PCR, ne fait l’objet d’aucun contrôle. L’ajout d’un nouveau contrôle (IC_DNA) directement dans le tampon de lyse, ainsi que des amorces permettant l’amplification spécifique de cet ADN synthétique dans le mix de pré PCR, permet de valider, conjointement avec le QS, que toutes les étapes du process se sont déroulées sans incident.
2017
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