Résumé

Le SCAGGEND-TRACES est capable de réaliser l'analyse de 4000 objets d’essais par mois. Or, dans les premiers mois de l’année 2013, le service en recevait plus de 10 000 par mois. Une augmentation de la capacité analytique de la chaîne devait donc être envisagée afin de répondre à la demande du terrain dans un temps plus court. La problématique de la capacité analytique ne doit pas pour autant occulter celle de la qualité du résultat. Ainsi, toute modification du processus ne peut se faire, a minima, qu'à rendement équivalent.

Le but de cette étude était de réaliser une optimisation des plateformes d’extraction BioRobot® Universal System en service au sein du SCAGGEND-T afin de réduire le temps d’analyse sans pour autant imputer le rendement.

L’adjonction d'une grille 96 puits sur la plaque servant à recueillir les lysats ainsi que l’adaptation logicielle idoine permet la réalisation de l'étape cruciale d'extraction de l'ADN en 2h45 au lieu de 4h15 auparavant, soit 1h30 de moins. Parallèlement, la réalisation d'une lyse à chaud et la centrifugation des prélèvements grâce au collier en forme de « u » permettent d’augmenter sensiblement le rendement et particulièrement pour les prélèvements les moins riches en ADN. Ce programme est également moins coûteux puisqu’il évite la consommation de nombreux consommables plastiques. 

2016